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2 · 第1學期細胞生物學膜生物學

擴散 vs 對流

Diffusion vs Convection

難度 3 · 進階cell-biologyphysicsmembrane想做成互動版

擴散與對流的精確處理涉及流體力學、統計力學、生物物理多個領域。現代生理學模型整合兩者,描述複雜的多尺度運輸現象。

Navier-Stokes 方程式

描述流體對流:
ρ(∂v/∂t + v·∇v) = −∇P + μ∇²v + f

含對流、壓力、黏滯、外力。Reynolds 數區分層流 vs 湍流:
Re = ρvL/μ

微血管 Re ~ 0.001(極層流);主動脈 Re ~3000(湍流臨界)。

對流-擴散方程式

∂C/∂t + v·∇C = D∇²C + S

左側對流項、右側擴散項與來源項。Péclet 數 Pe = vL/D 為對流項相對擴散項的無量綱比。

Stokes-Einstein 推導

結合:

  • Einstein 關係:⟨x²⟩ = 2Dt
  • Stokes 摩擦:F = 6πηrv
  • 漲落-耗散定理:D = kBT/ξ

得 D = kBT/(6πηr)。對非球形分子需修正。

異常擴散

⟨x²⟩ ∝ t^α:

  • α = 1:正常擴散(布朗)
  • α < 1:sub-diffusion(受困、擁擠)
  • α > 1:super-diffusion(流動、主動運輸

生物常見 sub-diffusion 機制:

  1. 障礙物(crowding)
  2. 結合-解離(receptor)
  3. 連續時間隨機行走(CTRW)
  4. 分形介質

Metzler-Klafter 理論:分數 Fick 方程式描述異常擴散。

Macromolecular Crowding

Minton 等量化:

  • 細胞質蛋白質 30-40% v/v
  • 排除體積效應放大結合 K(~10-100×)
  • D_eff = D/μ,μ ~ 3-5

影響:

Generalized Hydrodynamic Theory

非牛頓流體(如血液在小血管)需 Carreau、power-law 等模型。Fahraeus-Lindqvist 效應:小血管中血液黏度降低(紅血球軸向遷移)。

Lattice Boltzmann 與多尺度模擬

計算流體力學(CFD)多尺度方法:

  • 微觀:MD 模擬擴散
  • 中觀:Lattice Boltzmann
  • 宏觀:Navier-Stokes

應用於:人工血管設計、血腦屏障建模、藥物遞送預測。

單分子追蹤(SPT)

螢光標記單個分子,毫秒解析:

  • 揭示 D 分布(不只平均)
  • 識別 sub/super-diffusion
  • 偵測限制區域(confinement)

FLEXTorR、TrackMate 等軟體分析。

體外微流體(Microfluidics)

μm 尺度通道中:

  • Re < 1(層流)
  • Pe 中等
  • 設計藥物篩選、organ-on-chip

臟器晶片(lung-on-chip、gut-on-chip)模擬人體運輸環境。

Lymphatic system

淋巴系統的「慢對流」:

  • 速度極低(~1 mm/min)
  • 從組織液收集大分子(白蛋白)
  • 經淋巴結濾、最終回血液
  • 重要的免疫細胞遷移路徑

Glymphatic System(腦類淋巴)

2012 年 Maiken Nedergaard 發現:

  • 腦中沒有傳統淋巴
  • CSF 透過 AQP4 流經血管周圍空間
  • 清除代謝廢物(包括 β-amyloid)
  • 睡眠時活性最高

阿茲海默症與 glymphatic 失調相關。

Mass Transfer in Engineering

化學工程的「傳質」(mass transfer):

  • 對流質量傳遞係數 k_m
  • Sherwood 數:Sh = k_m L/D
  • Schmidt 數:Sc = μ/(ρD)

應用:分離、純化、反應器設計。

Drug Delivery

精準靶向遞送涉及多重運輸:

  1. 奈米粒子:被動靶向(EPR 效應)vs 主動靶向(抗體)
  2. liposomes、micelles:擴散透過膜
  3. 植入劑:擴散釋放
  4. 微針陣列:對流入皮
  5. 磁靶向:磁場引導對流方向

精準醫療與運輸

個體化藥動學考慮:

  • 個體血流分布
  • 組織擴散障壁
  • 代謝速率
  • 基因型(CYP polymorphism)

物理模型(PBPK)整合擴散與對流預測個體用藥反應。

前沿主題

  1. 大腦延伸的 connectome:神經元、血管網的擴散-對流交互
  2. 腫瘤穿透增強:突破腫瘤運輸障礙的策略
  3. CRISPR 遞送:mRNA-LNP 的擴散-對流動力學
  4. AI 預測藥物分布:機器學習從結構預測 PK
  5. 太空生理學:微重力下流體分布改變影響擴散-對流平衡
  6. 奈米孔感測:單分子擴散基礎的測序技術
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