染色質生物學的結構基礎由 Kornberg（1974, Science）建立——提出核小體為染色質基本單位。Luger et al.（1997, Nature）解析了核小體核心粒子 2.8 Å 結構，揭示 H3-H4 tetramer 和 H2A-H2B dimer 的組裝方式。
30 nm Fiber 的爭議
體外實驗長期支持 solenoid 或 zigzag 模型的 30 nm fiber。然而 Maeshima et al.（2014, Chromosoma）和 Ou et al.（2017, Science——ChromEMT 技術）的體內研究顯示間期染色質以 ~5-24 nm 的不規則折疊存在，而非有序的 30 nm fiber。「polymer melt / liquid-like chromatin」模型正在取代經典的分級折疊模型。
組蛋白變體（Histone Variants）
非典型組蛋白替代 canonical histone 以賦予特殊功能：
- H3.3：replication-independent deposition（HIRA/DAXX-ATRX chaperone），富集於 active genes 和 telomeres。H3.3 K27M 突變是兒童彌漫性中線膠質瘤（DIPG）的 driver——作為 PRC2 inhibitor 全域性降低 H3K27me3
- H2A.Z：啟動子的 +1 核小體，調控轉錄起始。SWR1 複合體催化 H2A→H2A.Z exchange
- CENP-A（CenH3）：centromere 特異性 H3 變體，定義功能性著絲粒
- macroH2A：X 染色體去活化和 senescence-associated heterochromatin
Phase Separation 與 Heterochromatin
Strom et al.（2017, Nature）和 Larson et al.（2017, Nature）同時發現 HP1α（H3K9me3 reader）透過 LLPS 形成液滴，提出 heterochromatin 是 phase-separated compartment。但 Gibson et al.（2019, Cell）以 reconstituted chromatin 實驗指出核小體陣列本身的壓縮可能足以解釋 heterochromatin，不一定需要 LLPS。HP1 phase separation 的必要性 vs 充分性仍在辯論。
染色質重塑在癌症中的角色
SWI/SNF（BAF/PBAF）複合體在 ~20% 人類癌症中突變（Kadoch et al., 2013, Nat Genet）。SMARCB1 biallelic loss 定義 malignant rhabdoid tumors；SMARCA4 loss 見於多種實體瘤和 SCCOHT。BAF 和 PRC2 是 antagonistic 關係——BAF loss → PRC2 unopposed → H3K27me3 升高 → EZH2 inhibitor（tazemetostat）可解救部分沉默基因。
單分子染色質結構
Micro-C（Krietenstein et al., 2020, Mol Cell）提供核小體解析度的 3D 基因組結構。單分子技術（如 fiber-seq 偵測 MTase-accessible DNA footprint、DiMeLo-seq 同時定位蛋白質佔據和 DNA 修飾）正在從群體平均走向單分子/單細胞的染色質結構圖譜。
文獻參考：Luger, K. et al. (1997). Nature, 389, 251-260. / Ou, H.D. et al. (2017). Science, 357, eaag0025. / Kadoch, C. et al. (2013). Nat Genet, 45, 592-601.