跳至主要內容
2 · 第1學期生物化學(上)碳水化合物代謝

糖解 10 步驟

Glycolysis 10 Steps

難度 4 · 專業biochemistrymetabolism想做成互動版

糖解作為真核與原核生物共享的中央代謝路徑,其機制、調控與臨床意義仍持續深化。本節著重於分子細節、調控網絡與疾病連結。

酵素細節

Hexokinase (Step 1)

  • 四種 isoenzymes(HK1-4),HK4 (Glucokinase) 在肝、胰島 β 細胞表達
  • HK1-3:K_m 約 0.1 mM(低親和力高效率)
  • HK4 (Glucokinase):K_m 約 8 mM、無 G6P feedback、適合血糖感應
  • Glucokinase MODY-2:突變引起 MODY 第 2 型糖尿病

PFK-1 (Step 3)

  • 四聚體 allosteric 酵素,T/R state 轉換
  • 受 ATP 抑制位點 vs 活化位點
  • Fructose-2,6-BP(F2,6BP)為 PFK-1 與 FBPase-1 反向調控的中央分子
  • PFK-2/FBPase-2 bifunctional 酵素由胰島素/升糖素磷酸化調控

GAPDH (Step 6)

  • 四聚體,每 subunit 含 Cys-149 活性位點
  • 反應機制:thiohemiacetal → thioester → phosphate displacement
  • Moonlighting functions:DNA 修復、apoptosis 調控、轉錄調控
  • COVID-19 中 GAPDH 受抑制與重症相關

Pyruvate Kinase (Step 10)

  • 四種 isoenzymes(M1, M2, L, R)
  • PKM2 在癌症中高表達,從活性高效態切換到低活性態使中間產物累積供合成代謝
  • L type(肝)受磷酸化(升糖素)抑制

Warburg Effect

Otto Warburg(1924)發現癌細胞即使有氧仍偏好糖解。現代理解:

  • PKM2 低活性使糖解中間產物供合成代謝(核酸、胺基酸、脂質
  • 快速分裂細胞需大量生物合成原料而非僅 ATP
  • HIF-1α 上調糖解酵素
  • ¹⁸F-FDG PET 利用 Warburg effect 進行癌症診斷

Vander Heiden et al.(Science 2009)綜述提出「Warburg effect 為生長必要而非異常」的現代觀點。

糖解中間產物的合成代謝命運

糖解不僅產 ATP,也提供 11 個生物合成前驅物:

  • G6P → Pentose Phosphate Pathway → ribose + NADPH
  • DHAP → 甘油 → triglycerides
  • 3-PG → 絲胺酸、半胱胺酸、甘胺酸
  • PEP → 芳香族胺基酸
  • Pyruvate → 丙胺酸、TCA cycle

DiBartolomeo et al.(2016)顯示糖解中間產物供應約 40% 細胞生物合成需求。

Glycolytic Oscillations

酵母懸浮液在低 O₂ 條件下糖解中間產物濃度週期性振盪(period 約 30-60 秒),由 PFK-1 的 allosteric 動力學驅動。此為非線性動力學經典範例,Selkov(1968)數學模型開創。

Cancer Therapy 標的

  • 2-deoxyglucose:阻斷 HK,臨床試驗
  • 3-bromopyruvate:HK-2 抑制劑
  • TLN-232:PKM2 modulator
  • Lactate 轉運蛋白 MCT1/4 抑制劑

遺傳性糖解酵素缺乏症

罕見但研究價值高:

  • PFK 缺乏(Tarui disease, GSD VII):運動不耐
  • PK 缺乏:溶血性貧血
  • PGK 缺乏:溶血 + 神經肌肉症狀
  • TPI 缺乏:致死性(中樞神經 + 溶血)

Glycolysis 與 Immunometabolism

T 細胞活化時切換到糖解優先模式(aerobic glycolysis),支援增殖與細胞激素產生。Pearce & Pearce(2013)提出免疫代謝重編程框架。糖解抑制劑(如 2-DG)影響免疫反應,是 cancer immunotherapy 新標的。

Glycolysis 在病原體中的重要性

  • 瘧原蟲完全依賴糖解(缺 TCA cycle 部分)
  • 抗結核藥物 isoniazid 影響 mycolic acid 合成而非糖解
  • 部分病原菌糖解酵素為疫苗候選

現代分子工具

  1. ¹³C metabolic flux analysis 量化糖解通量
  2. 螢光生物感測器(FRET-based)即時監測 ATP/ADP、NADH/NAD⁺、葡萄糖、丙酮酸
  3. 單細胞代謝體學揭示細胞異質性
  4. Spatial metabolomics 揭示組織內代謝分區
互動工具

動手玩玩看

用互動元件直接感受這個概念,比純文字快 10 倍搞懂。三個 tier 共用同一個工具。