大滅絕事件作為地球系統科學與演化生物學的交界，其機制、選擇性與演化後果在過去 40 年獲得深入剖析。
Big Five 的統計確立
Raup & Sepkoski（1982, Science）以海洋家族層級滅絕率的統計分析確立 Big Five。Sepkoski（1996）擴展資料庫。Bambach（2006, Annu. Rev. Earth Planet. Sci.）以物種層級更新分析，確認 Big Five 在物種尺度下同樣顯著。
K-Pg：撞擊假說的建立與驗證
Alvarez et al.（1980, Science）在 K-Pg 邊界黏土層發現銥異常，提出外星撞擊假說。此層在全球 >100 地點被確認（Smit, 1999, Annu. Rev. Earth Planet. Sci.）。Hildebrand et al.（1991, Geology）辨識 Chicxulub 結構為對應隕石坑。Schulte et al.（2010, Science）的 41 位作者共同綜述強化撞擊假說。
撞擊與 Deccan Traps 的相對貢獻長期爭議。Renne et al.（2013, Science）以高精度年代學顯示撞擊與 Deccan 噴發高峰幾乎同時；Sprain et al.（2019, Science）指出撞擊可能觸發 Deccan 噴發增強；Hull et al.（2020, Science）以海洋碳循環記錄顯示撞擊主導短期效應、Deccan 影響長期氣候恢復。
P-T：Siberian Traps 與複合機制
Erwin（1994, Nature）綜述 P-T 滅絕。Burgess et al.（2014, PNAS; 2017, Nat. Commun.）以 U-Pb 年代學精確定年 Siberian Traps 於 251.9-251.7 Ma，與滅絕時機吻合。機制複雜：
- 碳同位素 δ¹³C 大幅負偏（-6‰）暗示甲烷水合物釋放或有機碳庫扭動（Payne & Clapham, 2012, Annu. Rev. Earth Planet. Sci.）
- 海洋缺氧：黑頁岩沉積、Fe 與 Mo 地化標記（Lyons et al., 2014, Nature）
- 海洋酸化：Clapham & Payne（2011, Geology）的選擇性分析顯示重鈣化物種（珊瑚、腕足）受打擊最重，支持酸化假說
- 海洋暖化：Joachimski et al.（2012, Geology）conodont 氧同位素顯示赤道海水 ~40°C
- 火山直接效應：Chen et al.（2023, Sci. Adv.）氣溶膠+汞異常
Knoll et al.（2007, Earth Planet. Sci. Lett.）的 "physiological selectivity" 框架整合多重殺手機制。
選擇性滅絕的量化
Payne & Finnegan（2007, PNAS）以 meta-analysis 顯示：特化物種、大體型、低多樣化在大滅絕中易受影響。然而 K-Pg 的模式（Lockwood, 2003）與 P-T（Clapham et al., 2009）選擇性差異顯著，暗示機制特異。
Harnik et al.（2012, PNAS）以 Paleobiology Database 分析海洋無脊椎動物：地理範圍（geographic range）為跨滅絕事件的一致保護因子，高於生態特化度。
演化後果：empty niches 與輻射
- P-T 後復甦：Chen & Benton（2012, Nat. Geosci.）紀錄 Triassic 生態系重建歷時 ~8-10 Myr。魚龍、恐龍前身、哺乳類前身皆在此窗口起源。
- K-Pg 後哺乳類輻射：Meredith et al.（2011, Science）與 Foley et al.（2023, Science）以分子時鐘顯示哺乳類胎盤類主要目跨越 K-Pg，但物種層級輻射在 K-Pg 後爆炸。Halliday et al.（2017, Biol. Rev.）古生物學視角更強調 K-Pg 後輻射。
- 鳥類爆炸輻射：Jarvis et al.（2014, Science）的 phylogenomics 確認大多數現代鳥類目在 K-Pg 後的 ~10 Myr 內快速輻射。
第六次大滅絕的科學證據
Barnosky et al.（2011, Nature）確立框架：若當前速率持續，脊椎動物在 334-540 年內達到「大滅絕」規模（即 >75% 消失）。Ceballos et al.（2015, Sci. Adv.; 2017, PNAS; 2020, PNAS）更新估計與警告 biological annihilation。Díaz et al.（2019, IPBES report）：百萬物種面臨滅絕威脅。
Pimm et al.（2014, Science）估計現代滅絕速率為背景 1000 倍。然而 Vellend et al.（2013, PNAS）的本地尺度分析提出 nuance：local species richness 平均未減少，強調全球 vs 本地尺度差異。
驅動因子綜合：
- 棲地喪失：熱帶森林每年 ~10 Mha 消失
- 氣候變遷：IPCC 情境下 2100 年 1.5°C 升溫可導致 4% 物種滅絕；4.3°C 升溫可達 16%（Urban, 2015, Science）
- 過度採集：漁業崩潰、bushmeat
- 入侵種：Bellard et al.（2016, Biol. Lett.）統計入侵種為 58% 脊椎動物滅絕的原因之一
- 污染：化學、塑膠、光污染
大滅絕的時間尺度議題
Brannen（2017, The Ends of the World）通俗化指出大滅絕的「慢動作性」—— P-T 歷時 ~60 kyr，K-Pg 歷時 ~1 Myr（包含長期復甦）。當代滅絕速率若持續數世紀，在地質時間尺度下將完全符合 mass extinction 定義。
生態系統層級效應
Solé et al.（2010, Proc. R. Soc. B）建模大滅絕對生態網絡的影響：非隨機物種損失（特化、高 trophic level 優先）可觸發 cascading extinctions。Stouffer et al.（2012, Science）以網絡結構分析顯示食物網對 top predator 損失尤其脆弱。
深時間視角的慰藉與警示
演化從每次大滅絕後恢復，但復甦時間尺度（10⁵-10⁷ 年）遠超人類文明時間尺度。當代滅絕的速率與複合性（multiple stressors）對生物多樣性保護構成前所未有的挑戰。
前沿：(1) 整合古氣候、古地理與系統發生的「滅絕景觀」重建；(2) 古 DNA 解析大滅絕事件的分子基礎；(3) 保育古生物學（conservation paleobiology, Dietl & Flessa, 2011）應用過去指導現在；(4) 機器學習預測脆弱分類群（Finnegan et al., 2015, Science）；(5) 生態系統回復力與 tipping point 理論整合。